怪盜基德的預告信出現在了北海道函館，斧江財閥的收藏庫中。這次基德將要盜走的是，江戸幕府時(shí)期新選組副長(cháng)土方歲三的日本刀。向來(lái)追逐奢華寶石的怪盜基德，居然會(huì )看上刀？　　此時(shí)，被稱(chēng)作西部名偵探的服部平次和柯南一行人，也因為劍道大會(huì )來(lái)到了函館，在基德執行預告的當日，平次看穿了基德的偽裝并對其窮追不舍！　　同一時(shí)間，一具尸體在函館倉庫街被發(fā)現，尸體的胸口有一個(gè)十字傷口。搜查中，出現了一位被叫做“死之商人”的活躍于亞洲一帶的美籍日裔軍火商。這個(gè)人一直在尋找斧江家初代家主藏在函館的寶藏。斧江家江戸幕府戰爭時(shí)代深耕軍需產(chǎn)業(yè)，傳說(shuō)那寶藏是能扭轉幕末紛爭的強力武器，而這寶藏似乎和基德追逐欲盜取的刀有著(zhù)千絲萬(wàn)縷的聯(lián)系。在基德瞄準刀的同時(shí)，有一位劍士也在向基德逼近……